Bakterije su mikroorganizmi ili mikrobi koji se nalaze svugdje oko nas. Neke vrste bakterija čak žive na i u drugim organizmima, kao i ljudima.
Kao prvi oblik života koji je postojao na Zemlji, one od samog početka određuju uvjete našeg postojanja. L. reuteri primjer je bakterije koja je evoluirala u simbiozi s ljudima. Danas znamo kako bakterije predstavljaju sastavni dio našeg tijela. Iako se novorođenčad rađa gotovo sterilna, bakterije ubrzo započinju kolonizirati njihova malena tijela – kožu, usta i, što je najvažnije, probavni trakt. Te bakterije nastavljaju rasti i njihov sastav postaje sve raznolikiji do dobi od tri godine.